В суровые военные годы театр не прекращал работу. Артисты в составе фронтовых бригад выступали на передовой, в гарнизонах и госпиталях Ярославской области. Была поставлена 31 премьера, сыграно около тысячи спектаклей, их посмотрело более миллиона зрителей. Коллектив театра организовал сбор средств в фонд обороны. Деньги пошли на строительство военно-воздушной эскадрильи «Советский артист», специального самолёта «Театр имени Волкова», подарки бойцам Красной армии.
На сцене театра гастролировали: Аркадий Райкин и артисты Ленинградского театра эстрады и миниатюр (1941); Ленинградского государственного академического театра оперы и балета им. С. М. Кирова и Ленинградского театра музыкальной комедии, Краснознамённый ансамбль красноармейской песни и пляски СССР под руководством Александра Александрова (1942); артисты Московской государственной филармонии, железнодорожный джаз-оркестр под руководством Дмитрия Покрасса (1943); лауреат
Всесоюзного и международного конкурсов скрипач Давид Ойстрах, коллектив Ивановского театра музыкальной комедии (1944).
В 1943 году при театре сформировалась учебная студия. Первый состав студийцев — 5 девушек и 6 юношей. С будущими актёрами проводили теоретические занятия по технике речи, русской литературе, истории западноевропейского театра, танцу, музыкальной грамоте. Практическими занятиями для студийцев стало участие в массовых сценах спектаклей театра. После трёхлетнего обучения студия выпускала актёров драматического театра. В 1962 году на базе театральной студии создано Ярославское театральное училище, ныне — Ярославский государственный театральный институт. С 1960 по 1978 годы руководил театром народный артист СССР Фирс Шишигин. С его именем связан значительный этап истории Волковской сцены.
Стремясь увековечить образ Фёдора Волкова, театр не раз обращался к созданию спектакля о первом русском актёре. Автором всех сценических версий был актёр-волковец, драматург Николай Север. В 1960 году на сцене возникает романтическая драма «Фёдор Волков», режиссёра Рубена Вартапетова. Затем в 1963 году Фирс Шишигин ставит мощное народное действо, включая в него русские игрища, отрывки из драмы «Царь Максимилиан», эпизоды из трагедий Сумарокова «Хорев», «Синав и Трувор», маскарада «Торжествующая Минерва».
История и современность
С 1996 года главный режиссёр театра — Владимир Боголепов, вдумчивый художник, в прошлом учившийся у знаменитых волковских «стариков». Под его началом театр берёт курс на русскую и мировую классическую драматургию. В репертуаре на рубеже веков — «Фома» Фёдора Достоевского, «Кавказский роман» по «Казакам» и «Хаджи-Мурату» Льва Толстого, «Платонов» Антона Чехова, «Без вины виноватые», «Лес», «На всякого мудреца довольно простоты» Александра Островского, «Ревизор» Николая Гоголя. Мировая классика представлена «Гамлетом» Вильяма Шекспира, «Декамероном» Джованни Боккаччо, «Венецианскими близнецами» Карло Гольдони, «Перед заходом солнца» Герхарта Гауптмана.
С 1995 по 1998 год театр гастролировал по России и зарубежью: Нальчик, Новороссийск, Краснодар, Киев, Минск, Рига, Берлин, Братислава, Будапешт, Париж, Прага. На следующий год состоялся тур по северной Европе: Дания, Финляндия и Норвегия.
В мае 2000 года в Ярославле прошёл первый Международный Волковский фестиваль, девизом которого стали слова Михаила Щепкина: «Волкову всем мы обязаны…» В фестивале приняли участие оба МХАТа, Малый театр, Александринка, БДТ имени Г. А. Товстоногова, академические театры Нижнего Новгорода, Минска и Твери.
В 2001-м Правительством России были установлены премии имени Фёдора Волкова, которые вручаются ежегодно трём лауреатам.
В феврале 2009 года состоялась знаковая премьера. Спектакль по пьесе Александра Володина «С любимыми не расставайтесь» поставил известный актёр и режиссёр, заслуженный артист России Сергей Пускепалис. В конце июня того же года он стал главным режиссёром театра.
В конце апреля 2009 года Волковский театр совместно с Ярославским государственным театральным институтом организовали в Ярославле первый фестиваль «Будущее театральной России», который продолжил проводившиеся на рубеже веков фестивали театральных школ России.